蘇東啟於1953年參選雲林縣議員高票當選，此後一路連任四屆，他的言論不畏權勢、敢於評論時事，地方上更稱他為「蘇大砲」。
這樣的他，卻在1961年被當局指稱密謀奪取虎尾糖廠保警和空軍訓練中心的槍械，發動武裝革命、控制電台，號召台灣獨立，陸續被警總保安處逮捕四百多人，被判刑者五十人。
1961年蘇東啟與其妻蘇洪月嬌被逮補，國民黨大規模逮捕400多人，其後軍事檢察官起訴47人，覆判判決書有50人涉案，為首的蘇東啟原被判死刑，經法新社的記者報導後在國內外引起爭議，後改判無期徒刑，其妻則被判有期徒刑二年，抱著出生四個月的么兒蘇治原服刑。
如果有在關注白色恐怖相關案件的人，許多案件涉及人的真正逮捕原因，往往並不止於表面上的審判原因，表面的逮捕理由只是一種手段，目的正是清肅國民政府看不順眼的對象。
1960年，轟動一時的雷震案發生，蘇東啟就再雲林縣議會提議要求「蔣介石特赦雷震」並獲得 ＃全數通過，此舉雖然對於雷震的實際刑期並無太大幫助，卻是明目張膽在與國民政府對幹，蘇東啟因此成為官方眼中釘。
再外加上蘇東啟為首的相關人士本在1961年3月9日計劃奪取軍事訓練中心，發動武裝革命，以推翻蔣經國政權實現台灣獨立，期間也陸續說服許多台籍戰士，雖然後續因為條件不足而取消行動，是為「三九事變」，後卻遭線民舉報，再加上之前的雷震特赦事件，警總逮到了好機會，當然要趁機逮捕蘇東啟。
不過本案的受難者，有許多人根本對政治陌生、且與「三九事變」無涉，甚至蘇東啟的妻子因為「知情不報」，也受了兩年牢獄，是明顯的政治冤案；從原判到複判，最後都由蔣介石核定，顯示了本案當局涉入的深度，以及當局對蘇東啟的不滿。
蘇東啟的妻子蘇洪月嬌想起這樁案件時，仍堅毅地如此回答：「我下定決心，自己必須要堅強，我沒有悲傷的權利，我必須為我先生伸冤，這不只是蘇家的家務事，我必須為整個台灣做事，這是我的使命感。」
蘇東啟的女兒蘇治芬，即雲林前縣長、現任雲林立法委員，想起父親遭受過的一切，仍淚眼俱下地說：「父母親在險惡環境中，為台灣民主自由制度奮鬥不懈，是非功過留給史學家評論，但他們在逆境中戰鬥不懈的勇氣、鍥而不捨的毅力，與民主前輩李萬居，共同建立後代傳頌的雲林民主風骨。」
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